Ciao a tutti! ho inizato da poco a lavorare con la Real Time PCR (Sybr green) e ho alcuni dubbi operativi riguardo la threshold. Ho letto gli altri post sul tema, ma ho ancora le idee un pò confuse.
Da quello che ho capito le threshold possono essere settate manualmente avendo attenzione però di collocarle al di sopra del rumore di fondo e nella fase esponenziale della curva di amplificazione.
E' quindi consentito uniformare le threshold di corse differenti se rispetto questi parametri?
Cerco di spiegarm meglio.. Mi è capitato di analizzare lo stesso campione in due corse differenti, i Ct ottenuti per lo stesso gene sono risultati molto distanti tra loro, proprio a causa dei diversi valori di threshold calcolari in automatico dal software. Se però uniformo le Threshold delle due corse i valori risultano omogenei.