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Valentina B.
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15 Messaggi |
 Inserito il - 14 novembre 2013 : 20:33:10
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Ciao!
Il modulo di lettura più probabile è quello che ha un codone di stop il più tardi possibile o conta anche quanti codoni di stop ci sono nella sequenza considerata? o un mix di entrambe?
Facendo un esempio un po' estremo: una sequenza di 20 codoni:
modulo di lettura 1: ha un codone di stop al 10° codone
2: due codoni di stop a 11° e 12° codone
3: tre codoni di stop a 12°-13° e 14° codone
Un'altra cosa: almeno nei procarioti, individuato il codone AUG con la sequenza SD, posso ipotizzare non serva individuare la ORF, visto che quella giusta mi è già data dal codone di start.
Perciò, domanda: la determinazione della ORF è solo un espediente per quelle date sequenze che non comprendono -ahimé- il codone di start e la sequanza shine-delgarno?
Quando devo determinare l'ORF di una qualsiasi sequenza, e la scelgo, quell'ORF è solo un'ipotesi col 66% di probabilità di essere sbagliata, o è certezza?
Grazie!
Spero non le consideriate domande troppo stupide per dargli risposta.
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Determinazione ORF
Didattica
