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typoone
Nuovo Arrivato



3 Messaggi

Inserito il - 21 gennaio 2014 : 19:51:05  Mostra Profilo Invia a typoone un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, sono Andrea e sono nuovo nel forum. Mi sono iscritto per chiedere aiuto per la tesi di laurea che sto scrivendo. :)
Ho già utilizzato la funzione cerca ma non ho trovato niente che mi potesse aiutare...
Per contestualizzare la tesi parla della scelta di geni endogeni in mytilus, in particolare ne stiamo analizzando uno.
Devo spiegare in un capitolo della tesi le caratteristiche dei geni endogeni. In particolare non riesco a trovare informazioni su quali sono caratteristiche di un buon gene endogeno e le caratteristiche che NON deve avere un gene endogeno. Qualcuno può aiutarmi? Non credo che la semplice defnizione di gene endogeno basti :(
Grazie in anticipo!

typoone
Nuovo Arrivato



3 Messaggi

Inserito il - 23 gennaio 2014 : 11:03:54  Mostra Profilo Invia a typoone un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Nessuno sa come aiutarmi?
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domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 23 gennaio 2014 : 23:31:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Benvenuto sul forum Andrea.
Citazione:

Nessuno sa come aiutarmi?


Tanto per cominciare la domanda non è chiara. Per geni endogeni non è sinonimo di geni housekeeping. Per geni endogeni si intendono tutti i geni all'interno di una cellula (quindi geni che NON sono stati inseriti dall'esterno). Per geni housekeeping geni il cui livello di espressione resta costante nella cellula a seconda di diversi trattamenti. Questi sono utili in moltissimi saggi sperimentali (Real Time PCR, Western Blot, ecc).
Suppongo tu voglia sapere dei geni Housekeeping
Citazione:

Ho già utilizzato la funzione cerca ma non ho trovato niente che mi potesse aiutare...


E' un argomento trito e ritrito...Non puoi non aver trovato nulla.
Dai un occhio qui:
http://en.wikipedia.org/wiki/Housekeeping_gene
http://it.wikipedia.org/wiki/Gene_costitutivo
https://www.google.it/search?q=gene+housekeeping
http://www.molecularlab.it/forum/search
Qui uno che potrebbe esserti utile:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=7531&SearchTerms=housekeeping

Buono studio!!!

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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typoone
Nuovo Arrivato



3 Messaggi

Inserito il - 24 gennaio 2014 : 16:27:06  Mostra Profilo Invia a typoone un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie della risposta :)
Si, hanno usato i termini gene endogeno e housekeeping come equivalenti effettivamente nella scaletta della tesi ma mi riferivo ai geni housekeeping.
Avevo già letto i link che mi hai postato però non mi sono chiare quelle che sono le caratteristiche che deve avere un buon gene housekeeping e che non deve avere.
L'unica informazione che si avvicina di più a quel che cerco è questa :

For example, housekeeping genes were shown to
have shorter introns and exons [8–11], a different repetitive
sequence environment [enriched in short interspersed
elements (SINEs) and depleted in long interspersed elements
(LINEs)] [12,13], more simple sequence repeats in
the 50 untranslated region (UTR) [14], lower conservation
of the promoter sequence [15], and lower potential for
nucleosome formation in the 50 region of these genes
[16]. Protein products of housekeeping genes are enriched
in some domain families [17].

Estratta da una pubblicazione. Non mi è però chiara la traduzione dove parla di SINEs e LINEs...
In realtà credo non sia convenzionale la domanda che mi è stata posta, però ahimè devo rispondere comunque. Spero che questo articolo vadi bene, una vostra opinione più esperta è sicuramente gradita :)
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VerdianaR
Nuovo Arrivato

Verdy

Prov.: Padova
Città: Este


1 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2014 : 12:04:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di VerdianaR Invia a VerdianaR un Messaggio Privato  Rispondi Quotando

Salve a tutti! Sono una dottoranda in un laboratorio di biologia molecolare e cellulare ed ho un problema con gli housekeeping nei western blot... Ovvero, quando sviluppo (con lastre fotografiche) la proteina di mio interesse la vedo su tutti i campioni, ma poi, quando vado a normalizzare il risultato con l'espressione di un gene haousekeeping (in genere actina, GAPDH o alfa-tubulina) mi succede che in qualche campione non mi risulti la banda. Quindi non normalizzo niente!
Nessuno ha mai riscontrato questa problematica? Sapete come potrei fare per ovviare alla questione?

Grazie mille!!

Verdiana Ravarotto
PhD student
Lab. biol. molec. e cell.
Clinica Medica 4 DMED
University Hospital School,
University of Padova
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