Identificazione di possibili recettori

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phereo87
Nuovo Arrivato

1 Messaggi

Inserito il - 19 giugno 2014 : 16:02:47

Ciao a tutti!

Sto cercando un programma o server che mi permetta di identificare possibili recettori...

Ho la struttura di una proteina, e avrei bisogno di verificare se esistono recettori che potrebbero riconoscere un motivo di sequenza della mia proteina.

Qualcuno � a conoscenza di un prgramma afidabile in grado di far questo tipo di predizioni? Magari "pescando" possibili recettori dai depositi di pdb?

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 21 giugno 2014 : 16:25:19

Se cerchi qualcosa di generico il compito � davvero arduo, ti posto comunque una review che parla delle risorse online per fare analisi di PPI:

Citazione:
1: Tuncbag N, Kar G, Keskin O, Gursoy A, Nussinov R. A survey of available tools
and web servers for analysis of protein-protein interactions and interfaces.
Brief Bioinform. 2009 May;10(3):217-32. doi: 10.1093/bib/bbp001. Epub 2009 Feb
24. PubMed PMID: 19240123; PubMed Central PMCID: PMC2671387.

Se invece andiamo sullo specifico � il tuo "recettore" � un anticorpo o un TCR puoi guardare qui:

http://www.iedb.org/

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada