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mitzi
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
 Inserito il - 10 luglio 2014 : 04:05:15
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Ciao a tutti, sto preparando l'esame di bioinformatica ma non capisco cosa si intende per filamento positivo e negativo. Sto usando il browser genomico UCSC e li c'è soltanto uno dei due filamenti rappresentato..di quale si tratta? il positivo? corrisponde al filamento senso? Grazie!!
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6941 Messaggi |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 10 luglio 2014 : 16:03:39
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In che senso filamento positivo e negativo di RNA????
Per quanto riguarda i genome browser con filamenti positivo e negativo si intendono i gli strand senso e antisenso della doppia elica. Non ricordo quale dei due venga visualizzato. Dovresti controllare nelle FAQ ma, a naso, credo sia quello che viene effettivamente trascritto. |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 10 luglio 2014 : 16:44:12
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Citazione:
Messaggio inserito da kORdA
Per quanto riguarda i genome browser con filamenti positivo e negativo si intendono i gli strand senso e antisenso della doppia elica. Non ricordo quale dei due venga visualizzato. Dovresti controllare nelle FAQ ma, a naso, credo sia quello che viene effettivamente trascritto.
Non amo particolarmente UCSC e tendo a non usarlo, quindi non saprei di preciso neanche io, ma a naso non dovrebbe essere il contrario? Ovvero che viene indicato il filamento codificante? |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6941 Messaggi |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 10 luglio 2014 : 18:58:31
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Citazione:
Molecular biologists call a single strand of DNA sense (or positive (+) ) if an RNA version of the same sequence is translated or translatable into protein. Its complementary strand is called antisense (or negative (-) sense). Sometimes the phrase coding strand is encountered; however, protein coding and non-coding RNAs can be transcribed similarly from both strands, in some cases being transcribed in both directions from a common promoter region, or being transcribed from within introns, on both strands (see "ambisense" below).
In realta poi il discorso su complica un pochino come scritto qui:
http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download7 |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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mitzi
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
Inserito il - 10 luglio 2014 : 19:24:02
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Citazione:
Messaggio inserito da kORdA
In che senso filamento positivo e negativo di RNA????
Per quanto riguarda i genome browser con filamenti positivo e negativo si intendono i gli strand senso e antisenso della doppia elica. Non ricordo quale dei due venga visualizzato. Dovresti controllare nelle FAQ ma, a naso, credo sia quello che viene effettivamente trascritto.
Però c'è qualcosa che non mi torna, cioè non credo che si possa definire in modo assoluto un filamento senso e uno antisenso, perchè i geni stanno su entrambi i filamenti quindi l'assegnazione di senso e antisenso dipende dal filamento in cui si trova il gene. Non potrebbe essere semplicemente che il + è riferito al filamento che viene rappresentato in database e il - è l'altro complementare non rappresentato? |
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Dubbio filamento positivo e negativo
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