Stavo leggendo un campione di RNA appena estratto con uno spettrofotometro (Perkin Elmer) che ha due alloggiamenti, uno per la cuvetta con il bianco (acqua milliQ) e uno per la cuvetta con il campione di RNA. Ho tarato lo strumento leggendo il bianco e poi ho letto il campione ed ho ottenuto una concentrazione di circa 2 ug/ul e fin qui tutto ok. Siccome inizialmente avevo dei dubbi sulla presenza del pellet di RNA e avendo visto che ho ottenuto una concentrazione comunque alta (2ug/ul) ho pensato di leggere l'acqua milliQ per vedere che valori di assorbanza mi restituiva e mi ha dato dei valori assorbanza a 260 e 280 simili al mio campione di RNA...mi ha dato persino dei valori di concentrazione simili ...ma poi...concentrazioni di che nell'acqua??? e allora ho letto anche 1 ml di acqua RNasi-free comprata (Invitrogen)....e anche questa volta ho ottenuto dei valori di assorbanza e concentrazione simili a quelli del mio campione di RNA (e di altri campioni di RNA che avevo estratto precedentemente e per i quali sono sicura che il pellet c'era!!!
Quindi mi chiedo: se leggendo acqua milliQ e acqua RNasi free ottengo dei valori simili ai miei campioni di RNA, chi mi dice che nei miei campioni sto leggendo davvero RNA???? C'è qualcosa che non mi torna...potete aiutarmi???
Ciao fantassmina! Decisamente c'è qualcosa che non torna!!!
Citazione: cuvetta con il bianco (acqua milliQ) [...] Ho tarato lo strumento leggendo il bianco [...] ho pensato di leggere l'acqua milliQ per vedere che valori di assorbanza mi restituiva e mi ha dato dei valori assorbanza a 260 e 280 simili al mio campione di RNA
(Se ho capito bene) il tuo bianco è l'acqua milliQ, quindi azzeri con acqua milliQ, poi leggi l'acqua milliQ e questa ti dà un valore di assorbanza diverso da 0 !?!? Questo non può essere...Usi sempre la stessa acqua? Invece di dirci la concentrazione in ug/ul puoi scrivere queste assorbanze?? Le soluzioni che usi sono fredde? Se sì, a volte capita che la cuvetta di quarzo si appanni e la luce non passa, assicurati di asciugarle con la carta prima di leggerle...