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Joel
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 13 gennaio 2015 : 09:59:05
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Ciao a tutti, oggi vorrei sottoporvi alcune domande riguardo il crossing over che sono state poste singolarmente in altre discussioni del forum, ma non in quest'ottica, ossia:
1) Leggendo su internet trovo che due geni non possono distare più di 50cM. Ossia (e correggetemi se sbaglio) che la loro distanza è tale che al massimo avvengono 50 ricombinazioni ogni 100, il 50%. Ciò non me lo spiego, perchè non capisco cosa vieta a due geni di ricombinarsi 60 volte su 100, o 80, o 90 e così via... Allora in internet trovo scritto che la frequenza di ricombinazione è massimo al 50% perchè si ricombinano solo i cromatidi vicini dei cromosomi omologhi, ma comunque non mi spiego questa immagine: https://mattiasegu.files.wordpress.com/2013/05/images.jpeg?w=479 in cui anche i cromatidi più esterni si ricombinano!
2) Trovo anche scritto che in realtà frequenze di ricombinazione superiori al 50% esistono, ma sono relative a geni che si comportano da indipendenti. Questa affermazione mi è del tutto oscura 
Grazie a quanti vorranno aiutarmi 
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2015 : 19:45:36
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Citazione:
Leggendo su internet trovo che due geni non possono distare più di 50cM
Questo non è vero! Altrimenti i geni su un cromosoma sarebbero tutti appiccicati da una parte e il resto del cromosoma sarebbe vuoto!
Non puoi osservare una frequenza di ricombinazione maggiore del 50%, ma se il hai questi tre geni sul cromsoma: ABC
e vedi che A e B distano 40cM, mentre B e C distano 30cM allora la distanza tra A e C è 40+30 = 70cM, anche se la frequenza di ricombinazione che osserverai considerando solo A e C sarà 50%.
Per il resto la spiegazione è questa:
Se hai un singolo crossing over questo avviene solo tra due filamenti su 4, quindi il massimo di ricombinanti è 50%.
Quello che hai indicato in figura è un triplo crossing over che coinvolge 4 filamenti, cosa abbastanza complicata... non so da dove venga la figura e cosa volesse rappresentare, comunque la questione è abbastanza complicata, lascerei perdere i tripli crossing over e mi limiterei ai doppi. (poi per i tripli valo lo stesso ragionamento, ma fare tutta la spiegazione è piuttosto complicato)
Quindi... tornando ai doppi crossing over:
un doppio crossing over può coinvolgere diversi filamenti:
1) doppio c.o. a 2 filamenti (filamenti 2-3)
2) doppio c.o. a 3 filamenti (filamenti 2-3 e 1-3)
3) doppio c.o. a 3 filamenti (filamenti 2-3 e 2-4)
4) doppio c.o. a 4 filamenti (filamenti 2-3 e 1-4)
queste 4 opzioni sono equiprobabili, quindi avverranno tutte con la stessa probabilità, in una cellula avverrà una opzione, in un altra un altra... ecc...
Alla fine se conti i parentali e ricombinanti "finali" dati dalla somma di queste 4 opzioni equiprobabili vedrai che sono il 50%.
ovviamente il discorso con i tripli c.o. è analogo... ma non mi metto certo a fare tutti gli esempi...  |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2015 : 19:48:12
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Ah dimenticavo:
Citazione:
Messaggio inserito da Joel
2) Trovo anche scritto che in realtà frequenze di ricombinazione superiori al 50% esistono, ma sono relative a geni che si comportano da indipendenti. Questa affermazione mi è del tutto oscura
No questa cosa è sbagliata, il massimo di frequenza di ricombinazione è 50%, per quelli indipendenti è 50%.
Solo distanze di mappa superiori a 50 esistono (come ti ho detto all'inizio) ma MAI frequenze di ricombinazione superiori al 50%! |
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Joel
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2015 : 21:42:25
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| Risposta a dir poco precisa e chiara. Davvero grazie mille, era un problema su cui lavoravo da tempo senza risultati e alla fine é piuttosto semplice! Grazie |
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Crossing over, geni associati e concatenati
