clonaggio nell'era post genomica, esperimento di proteomica

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Lavinia94
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34 Messaggi

Inserito il - 19 maggio 2015 : 17:09:39

Isolo una proteina
Faccio una spettrometria di massa ottenendone la sequenza
Voglio risalire alla sequenza di RNA corrispondente e isolare il cDNA corrispondente.
Ci possono essere 3 casi:
1) La sequenza non esiste in banca dati > si procede come in era pre genomica (CIOE'??????)
2)la seq corrisponde a degli EST
3) La seq appartiene a una proteina gi� nota > in questi ultimi due casi oridinare EST da utilizzare per studi funzionali o come sonda, oppure amplificare seq tramite PCR (a che mi serve?)

Cosa mi garantisce che la sequenza nella libreria � la stessa che trovo nel mio paziente e che non sia solo la est uguale? come faccio a risalire alla vera sequenza? come faccio a isolare il cDNA dal paziente?

E poi in che modo le EST possono essere errate?
Che c'entrano le UTR?

Altra domanda: Nei vettori i marker non hanno promotori?