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integrase virus HIV BLAST

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Erica_93
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1 Messaggi

Inserito il - 05 gennaio 2017 : 19:47:46

Ciao a tutti! Scrivo in piena disperazione pre- esame di bioinformatica. Il prof ci ha dato una relazione da svolgere seguendo una traccia. Mi � stata assegnata una proteina codificata dal virus dell'HIV-1. Quando sono andata a fare BLAST con la proteina mi ha trovato tantissime sequenze tutte nominate allo stesso modo della mia e cio�: integrase[Human immunodefiency virus 1]. Aprendole alcune sono identiche anche nella sequenza altre differiscono. Il punto � che non riesco a capire perch� nonostante sono tutte nominate in maniera identica e molte sono identiche anche nella sequenza, sono registrate nel database tutte sotto codici ncbi diversi.
Non so nemmeno se mi sono spiegata bene ma sono disperata, anche perch� poi ho dovuto farci l'albero filogenetico con queste sequenze e non vorrei aver sbagliato anche quello! Help please