Sono alle prese con una ligazione che mi sta dando un pò di problemi, inserto da 1.5 kb e vettore da 2.5 kb estremità sticky. Ho fatto diverse condizioni inserto vettore e ho ottenuto diverse colonie in condizioni diverse tra loro (1:3-1:5 v/i principalmente). Tuttavia il risultato dello screening con doppia digestione è sempre negativo (vettore richiuso) e in 2 casi sembra esserci un vettore contaminante in quanto la doppia mi da pesi di vettore e inserto non conformi a quanto ligato. Stavo pensando di provare la CIP che per motivi di tempo e per aumentare la resa non ho mai usato. Che protocolli usate? Va sempre purificato il DNA dopo l'utilizzo della CIP?