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 miRNA e loro target validati sperimentalmente
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maurizioolla
Nuovo Arrivato


Città: Cagliari


22 Messaggi

Inserito il - 11 aprile 2007 : 11:09:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di maurizioolla  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di maurizioolla Invia a maurizioolla un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti.
Il mondo dei miRNA è, per ovvi motivi, per buona parte bioinformatico. Tools in continua evoluzione come Pictar e TargetScan e Miranda predicono i geni target dei miRNA. Sono però target putativi, in attesa di validazione sperimentale. Qualcuno è a conoscenza di paper o altro dove viene riportata qualche sequenza di miRNA e del/i loro target validati sperimentalmente?

Thanks in advance

stefania violini
Nuovo Arrivato



1 Messaggi

Inserito il - 16 aprile 2007 : 10:01:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di stefania violini Invia a stefania violini un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il più completo database è il Sanger- UK.
http://microrna.sanger.ac.uk/index.shtml

Stefania
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maurizioolla
Nuovo Arrivato


Città: Cagliari


22 Messaggi

Inserito il - 22 aprile 2007 : 11:40:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di maurizioolla  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di maurizioolla Invia a maurizioolla un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie stefania, il database che mi hai indicato è veramente completo.

Il problema è che lì sono indicati i gene putativi, cioè quelli preditti computazionalmente, tra cui, come sai, ci sono molti falsi positivi.

A me interessa un database (o anche qualche paper) in cui i target siano stati validati sperimentalmente.

Qualcun altro mi può aiutare

Thanks in advance e buona domenica a tutti

Mau
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