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movimento
Utente Junior


Città: napoli


302 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 00:58:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di movimento  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di movimento Invia a movimento un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
mi elencate TUTTI i legami che ci sono nel duplex di dna?



grazie ragazzuoli

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 06:07:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora, le unità di desossiribosio hanno il fosfato legato all'idrossile in 5' e legano lo zucchero precedente con l'idrossile in 3' (che lega il fosfato dell'altro zucchero).
In 1' lo zucchero lega la base azotata.

Ci sono poi i legami idrogeno fra le basi di ciascuna coppia, 2 per A e T e 3 per C e G.
Ci sono interazioni idrofobiche tra gli orbitali pi greco di coppie di basi adiacenti
Ci possono essere legami idrogeno fra basi adiacenti sulla stessa catena, dovute al fatto che la coppia di basi può ruotare attorno al suo asse per stabilizzare la doppia elica e quindi può interagire con la coppia successiva.

Ora come ora non me ne vengono in mente altri

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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 10:04:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io ricordavo che le interazioni tra gli orbitali pi greco
riguardassero più le strutture aromatiche "impilate" che non quelle adiacenti...

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

Less Jim Morrison, more Sean Morrison!


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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 12:44:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Forse mi sono espresso male, con coppie di base adiacenti intendevo basi successive nella sequenza.
Ad es:


5' 3'
A--T
:  :
C--G
:  :
C--G
:  :
A--T
3' 5'

Le interazioni pi greco sono segnate con : e i legami H con --

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movimento
Utente Junior


Città: napoli


302 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 14:33:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di movimento  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di movimento Invia a movimento un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ma le interazioni pi greco non sono quelle covalenti?
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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 16:26:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No movimento, le interazioni tra le basi aromatiche rappresentano la coniugazione
degli orbitali delocalizzati (pi greco appunto) che sono parte, in ciascuna base,
dei doppi legami covalenti responsabili dell'aromaticità: l'interazione coniugativa
tra basi diverse non è però covalente, ma vede una sorta di 'impilamento' delle basi
azotate come a formare una colonna, nella quale gli orbitali pi greco mischiano i
loro elettroni. A rinforzarla c'è pure una certa repulsione idrofobica che mantiene
l'elica chiusa, lasciando all'esterno i gruppi fosfato carichi e quindi idrofili.

Il mio professore di biochimica insisteva sul fatto che NON
sono i ponti H a tenere chiusa l'elica (troppo deboli!) ma
è questa sinergia tra forze idrofobiche e interazioni pi greco
a fare della doppia elica una strutture compatta. I ponti H
sono solo responsabili di una geometria spaziale particolarmente
stabile, che viene deformata nel fenomeno del mismatch....

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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