Salve a tutti. Ho difficoltą a capire un passaggio di un esperimento in merito alla trasfezione. Ho un campione di cellule HeLa dove voglio verificare gli effetti del silenziamento di un gene. Per fare ciņ effettuo una trasfezione con plasmidi codificanti short hairpin RNA specifici per il gene da trasfettare. Fino a qui tutto ok. Per quanto riguarda i controlli,perchč si procede effettuando una trasfezione con shRNA CONTRO una SEQUENZA RANDOM DEL GENE GFP??? La GFP in tal modo non viene silenziata? Qual č lo scopo di questo silenziamento nei controlli?
Il tuo "trattamento" (la trasfezione di per sč) causa degli effetti alla cellula. Come fai a sapere se quello che vai a vedere sarą l'effetto del tuo gene silenziato e non dovuto al trasfezione di per sč? Usi come controllo un shRNA contro una sequenza che non esiste nella cellula. In questo modo se quello che misuri č uguale nel controllo e nel tuo esperimento sai che č dovuto alla trasfezione e non al gene silenziato. Pił chiaro?
Grazie mille domi84! Sei stato molto chiaro! Questa purtroppo č la mia prima esperienza in laboratorio in quanto sto svolgendo un tirocinio per la tesi,dunque a volte o non riesco ad esporre i miei dubbi e le mie perplessitą per questioni di tempo oppure per evitare di fare figuracce! Ti ringrazio ancora! [quote]Messaggio inserito da domi84
Il tuo "trattamento" (la trasfezione di per sč) causa degli effetti alla cellula. Come fai a sapere se quello che vai a vedere sarą l'effetto del tuo gene silenziato e non dovuto al trasfezione di per sč? Usi come controllo un shRNA contro una sequenza che non esiste nella cellula. In questo modo se quello che misuri č uguale nel controllo e nel tuo esperimento sai che č dovuto alla trasfezione e non al gene silenziato. Pił chiaro? [/quote