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abies
Nuovo Arrivato
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 Inserito il - 31 luglio 2020 : 10:29:00
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Buongiorno a tutti,
spero di aver inserito questa nuova discussione nella sezione giusta. Vi scrivo per chiedervi un consiglio nel dipanare un dubbio che mi sta bloccando da giorni. Per le mie attività di tesi, ho trattato delle piantine di Arabidopsis (una linea wt e una linea mutante) con due trattamenti, aria (controllo) ed ipossia, al fine di analizzare l'espressione relativa di alcuni geni anaerobici, tramite il metodo del 2^-#916;#916;Ct. Come suggerito dal mio relatore, dovrei eseguire un'ANOVA a due vie su R(seguita da un test post-hoc) per osservare quali geni siano differenzialmente espressi. Ho cercato a lungo su google, e ho trovato che l'analisi statistica non dovrebbe essere fatta sui valori di fold-change, perché non distribuiti normalmente, bensì sui valori di #916;Ct. Ho provato ad analizzare i valori 2^-#916;#916;Ct con il test di Shapiro-Wilk, ed in effetti non risultano normalmente distribuiti. Non so cosa fare: utilizzare i valori di fold-change, magari impiegando test non parametrici (Wilcoxon)? Vi chiedo gentilmente a voi, il mio relatore non risponde a questa domanda.
Nell'attesa, grazie.
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Come eseguire un'analisi statistica sui valori 2^-ddCt?
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