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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 09 giugno 2007 : 11:29:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Al termine del western blotting, dopo lo sviluppo della lastra, ho notato delle regioni bianche sulla lastra, anche se era presente comunque la banda relativa alla proteina d'interesse.

La presenza di quelle regioni bianche a mio avviso potrebbe essere determinata dai seguenti fattori:
1) Eccesso di anticorpo primario
2) Problemi nella corsa elettroforetica
3) Trasferimento non eccellente su membrana

Ho utilizzato un anticorpo sperimentale che quindi non è il massimo, su campioni proteici di tessuto.

La presenza inoltre di bande a basso peso molecolare, potrebbe essere dovuta all'anticorpo non proprio specifico contro la proteina di interesse oppure magari al collagene presente nei campioni di tessuto corsi su gel?

Cosa ne pensate?

Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 09 giugno 2007 : 12:11:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Fissaggio troppo breve. La prossima volta mantienila più tempo nel liquido fixer.

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 09 giugno 2007 : 19:11:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non avevo pensato al fissaggio, perchè le zone bianche sono verso il centro della lastra e non presenti in tutta la regione che ha aderito al filtro. La prossima volta proverò comunque anche a tenere di più nel liquido di fissaggio.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 10 giugno 2007 : 00:21:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Usi ECL? Perchè è quello che succede quando non distribuisci bene il liquido sulla membrana.

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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 10 giugno 2007 : 11:39:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si uso ECL dell'Amersham.
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Iside
Utente Attivo

Iside_paradise

Città: Napoli


1375 Messaggi

Inserito il - 10 giugno 2007 : 12:35:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Iside  Invia a Iside un messaggio Yahoo! Invia a Iside un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io per evitare macchie sulle lastre quando espongo l'ECL tengo la membrana in movimento, cioè ci metto l'ECL e poi la appoggio su una basculante a forte velocità. Il movimento durante l'esposizione minimizza le macchie. prova


...we're just two lost souls swimming in a fishbawl...year after year...
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 10 giugno 2007 : 12:37:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora potrebbe semplicemente un problema di quando hai messo l'ECL. La soluzione più veloce sarebbe rifare il blotting e vedere cosa viene fuori.

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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 10 giugno 2007 : 14:47:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono d'accordo.
Se il problema si ripete, anche distribuendo bene l'ECL e fissandola per molto tempo,
allora forse è il caso di ripreparare la soluzione fixer. In genere è colpa del fissaggio
quando nella lastra trovi zone bianche o pallide (tipo 'annebbiate').

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Biochica
Utente Junior




285 Messaggi

Inserito il - 13 giugno 2007 : 10:00:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Biochica Invia a Biochica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Si uso ECL dell'Amersham.

hai provato a guardare la data di scadenza? a noi è successa una cosa simile con l'ecl dell'amersham scaduto (da un paio di settimane)...da quel momento siamo passati al western pico della pierce

Io non sono cattiva...è che mi disegnano così...
-Jessica Rabbit-
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