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Gabry
Nuovo Arrivato


Prov.: Ancona
Città: santa maria nuova


64 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 12:43:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gabry  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Gabry Invia a Gabry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve a tutti. sono uno studente universitario di biotecnologie e devo sostenere un esame di biotecnologie vegetali.

come prova d'esame devo presentare un ppt su un argomento.

studiando ho trovato dei termini che non riesco a trovare neanche sui motori di ricerca.
questi termini sono:

MADS-domain;
FLP

chiunque ne sappia qualcosa o mi sappia dare delle dritte può contattarmi.

grzie e ciao

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 14:15:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Benvenuto sul forum!

Quei nomi mi sanno tanto di sequenze proteiche, soprattutto il primo... se ci contestualizzi un po' di più la situazione magari ti sapremo dire di più!

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Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6941 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 14:29:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sequenze amminoacidiche semmai...

Per il secondo ci vorrebbe davvero un contesto, però ho trovato questo:
http://www.springerlink.com/content/fva9e8ctk153t54v/

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 15:10:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono domini proteici:
MADS = MCM1, Agamous, Deficiens, and SRF (serum response factor) box family of eukaryotic transcriptional regulators
FLP = Flp recombinase

Se guardi su NCBI e cerchi i termini nella categoria CCD (conserved domain) li trovi:

MADS
INT_Flp
MADS-Conserved Domain Results
flp-Conserved Domain Results

come FLP esiste anche: "Flp pilus assembly protein, pilin Flp ", ma credo che nel tuo caso sia più facile si tratti della ricombinasi.


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Cangrande
Utente Junior

Cangrande Della Scala

Prov.: Verona


280 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 15:12:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Cangrande Invia a Cangrande un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Proteine con dominio MADS- A family of proteins that has been targeted for much study in this mustard plant is the MADS domain family and includes proteins that regulate flower development and seed dispersal in Arabidopsis. There is some speculation that these proteins may also play a role in the regulation of embryonic development.
io avevo questo lavoro http://www.wisc.edu/cbe/srp-bio/pdf/2001_mertens_compressed.pdf

Magnifico atque victoriosissimo Domino, Domino Kani Grandi de la Scala.
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Gabry
Nuovo Arrivato


Prov.: Ancona
Città: santa maria nuova


64 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 18:51:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gabry  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Gabry Invia a Gabry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sto studiando una relazione su un gruppo di gene omoeotici di Arabidopsis.

leggendo ho trovato che in questa piante vengono espresse delle proteine (AP3 e PI) che sono costiutie da un dominio MADS. i link per questo termine sono stati utili ma non riesco ancora a capire se ha un funzionamento particolare degno di nota o è stato menzionato esclusivamente per una caratterizzazione generale delle proteine.

invece, per quanto riguarda FLP esso si tratta di una tecnica usata per generare chimere ma non viene descritto il suo funzionamento e non ho trovato nulla di utile.

cmq grazie mille delle risposte che mi avete dato. se avete altre notizie o suggerimenti ne sarò contento...


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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2007 : 20:38:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando

Riguardo al domino MADS presente nelle proteine omeotiche AP3 e PI è un dominio che permette la dimerizzazione (AP3 e PI si possono infatti legare e formare un eterodimero) e il legame al DNA (il dimero AP3-PI si lega al DNA e funge da attivatore trascrizionale).
Questo lo puoi vedere anche nell’articolo che ha postato prima Cangrande o ad. es in questo: DNA-binding properties of Arabidopsis MADS domain homeotic proteins APETALA1, APETALA3, PISTILLATA and AGAMOUS


FLP come dicevamo è una ricombinasi (da Saccharomyces cerevisiae) e agisce nel sistema FLP-FRT recombination system (analogo al sistema Cre/lox).
In poche parole FLP riconosce delle sequenze chiamate FRT (FLP recombination target sites) e a livello di queste excide il DNA. Se ho una sequenza fiancheggiata da due sequenze FRT (la seconda è invertita), ad es.:
nnnnnnnn FRTNNNNNNTRF nnnnnnnn

la FLP ricombinasi agirà tagliando la sequenza e avrai:

nnnnnnnnnnnnnnnn


è quindi un sistema per “inibire” un determinato gene. Poi bisognerebbe vedere cosa dice di preciso la relazione che stai leggendo, comunque questo articolo è uno dei tanti esempi di come il sistema è stato utilizzato in Arabidopsis:
FLP-mediated recombination for use in hybrid plant production

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Gabry
Nuovo Arrivato


Prov.: Ancona
Città: santa maria nuova


64 Messaggi

Inserito il - 12 giugno 2007 : 11:56:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gabry  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Gabry Invia a Gabry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie per le risposte che mi avete dato

la relazione che sto leggendo parlava di questi due termini e non sapevo cosa fossero.
era solo una mia curiosità per conoscere queste tecniche che non ho mai sentito nominare.

grazie mille a tutti. mi avete salvato l'esame.

grazie grazie
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