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Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1915 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2007 : 22:03:10

Salve,ho questo lavoro da fare:
Analizzare con genscan la regione del genoma umano NC_000012.10 (119900931...119924697)quindi caratterizzare la sequenza proteica predetta

il problema e' che cercando nelle banche dati e inserendo l accession number mi ritrovo con un sacco di contig che non cadono in quella regione..se qualcuno e' piu' esperto in questo lavoro mi puo'dare una mano ?thanks

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 26 giugno 2007 : 04:06:07

Pat hai cambiato il titolo dopo il post di dallolio???

Comunque non sono un'esperta e non so se ho capito giusto... poi vista l'ora...
Io ho provato a cercare in NCBI "Nucleotide" e ne trova 1 sola di sequenza:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?term=NC_000012.10&cmd=Search&db=nuccore&QueryKey=2

poi ho preso dal contig 119900931 a 119924697, incollato in Genscan e ho ottenuto questo:

Allegato:

GENSCAN ou.pdf
112,21 KB

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1915 Messaggi

Inserito il - 26 giugno 2007 : 08:36:18

Buondi' !
pero' ha funzionato il cambiamento del titolo !

ti ringrazio per la ricerca ,cmq io continuo a vedere una "matriosca "di contig... stasera mi dedico di piu' e uscira' di sicuro

,anch io non sono un esperto anzi e' la prima volta che lo faccio questo lavoro,lo dovevamo fare in lab solo che per via della connessione che non c'e' stata non l abbiamo piu' fatto

..la prossima volta vi trovo un titolo ancora piu' bello

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 26 giugno 2007 : 18:03:10

Buongiorno!!!
Ho il fuso un po' sballato...

va beh vediamo cosa ti esce fuori...