Ciao a tutti domani ho l'esame e sono in crisi.... potreste dirmi in cosa consiste la pcr colony e come si procede nella preparazione? grazie a chi mi risponderà
La Colony PCR serve per screenare dei cloni (batterici o di lievito) e verificare se è avvenuta l’inserzione del frammento nel plasmide.
In breve si procede in questo modo:
Si preleva con un ansa sterile parte della colonia che si vuole analizzare, si risospende in acqua sterile e la si utilizza come campione per la PCR. (alcuni mettono direttamente la colonia nella mix di PCR)
Si esegue una normalissima PCR che amplifica il frammento che “dovrebbe” essere inserito nel plasmide e si analizzano i risualtati su gel di agarosio.
Se visualizzi la banda vuol dire che il clone contiene il frammento altrimenti no!
io infatti "inzuppo' la colonia direttamente nel pcr mix! L'unico step diverso che faccio rispetto ad una normale pcr e' uno step di denaturazione iniziale + lungo (10 min) per lisare completamente coli.