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Inserito il - 03 settembre 2007 : 17:38:44
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Salve, stavo cercando dei dati aggiornati (e magari un bel grafico) sul divarsio sequenze/strutture proteiche. In rete ho trovato grafici che si fermano al 1995... Qualcuno conosce qualche indirizzo, forse di qualche banca dati, con le statistiche aggiornate?
Grazie.
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dallolio_gm
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:08:52
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Sono sicuro di aver visto il grafico che cerchi su pdb.org, anche se ora non lo ritrovo. Forse nella pagina 'about' o 'statistics'.
Cmq, per le strutture puoi cercare su pdb.org: e per le sequenze, su ncbi. Forse c'è anche qualche articolo su pubmed o su qualche blog di bioinformatica. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:15:43
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Ci sto sbattendo la testa... Non riesco a trovare niente. L' unica cosa è questa: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/genbankstats.html
E quindi le sequenze proteiche al 2005 dovrebbero essere più di 52 milioni. Ma le statistiche sulle strutture dove caspita le trovo? Possibile che non ci sia un grafico a livello mondiale? |
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dallolio_gm
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:20:01
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Citazione: Ma le statistiche sulle strutture dove caspita le trovo
http://www.wwpdb.org/stats.html |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:23:23
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Ma oggi è il primo di aprile? Perché non riesco a connettermi? Tu ci riesci? Grazie e scusa per il fastidio... |
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dallolio_gm
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:40:19
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Strano... io non ho problemi.
Cmq le statistiche sono queste:
PDB Structures Released Per Year*
Year Total
2000 2631
2001 2835
2002 3013
2003 4182
2004 5213
2005 5405
2006 6543
2007 4554
Total 34376
*Note: Experimentally solved structures (excluding obsolete structures)
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 18:47:06
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Incredibile, non riesco proprio a connettermi. Neanche alla homepage. Vabbè. Ti rigrazio vivamente, sei stato molto gentile.
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dallolio_gm
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 19:11:21
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De nada, sicuramente si può trovare di meglio cmq... se becco qualcosa ti faccio sapere.
p.s.: motore di ricerca per argomenti scientifici: http://scirus.com |
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Inserito il - 03 settembre 2007 : 19:33:47
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Ho trovato un grafico in un lavoro di Eisenhaber, F., Persson, B. and Argos, P. (1995). Ma i dati sono riferiti agli anni 1987-1994. Possibile che non ci sia niente di più aggiornato? Difficilmente potrò inserire un grafico coi dati presi così approssimativamente...
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