ciao, facendo un gel di proteine ho riscontrato delle bande, nel pozzetto dove era stata caricata la mia proteina purificata, di peso molecolare piu' alto..dopo averne fatto la spettroscopia di massa ho rivelato la presenza di nuova proteina...vorrei sapere come potrei fare ad estrarre la proteina dal batterio conoscendo la sequenza? da dove devo partire???? devo prima creare un costrutto o qlc del genere!!! Grazie Elvira
Io vedrei se fosse in qualche modo possibile usare degli anticorpi. Questa proteina è una variante di altre proteine note? Prova a controllare se vendono anticorpi x quella specifica proteina.
Grazie per avermi risposto! penso tu abbia ragione, quindi tu pensi che io dovrei costruire un anticorpo contro qst proteina, scusa la domanda stupida ma poi come estraggo la proteina che si e' legata all'anticorpo?..mi chiedo praticamente come si possa fare? Grazie Elvira
Si può fare con una cromatografia di affinità con una resina derivatizzata con l'anticorpo, in modo da legare solo la proteina di interesse. Tuttavia questo approccio comporta numerosi problemi: 1) fare un buon anticorpo per una proteina non è così immediato e semplice, soprattutto se questa proteina è una variante di un'altra espressa nello stesso sistema; conta che ci possono volere molti mesi per ottenere un buon anticorpo. Certo, se esiste già un anticorpo in commercio la cosa è molto diversa... 2) per fare una cromatografia devi avere una discreta quantità di proteina, oppure potrebbe essere difficile lavorarci (ma se la estrai da batteri non ci dovrebbero essere problemi di quantità).