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Discussione

marchino
Nuovo Arrivato

1 Messaggi

Inserito il - 26 settembre 2007 : 16:15:03

Salve a tutti.
Ho trovato nel promotore di un gene un response element per un fattore di trascrizione, pero' il response element non e' in direzione 5' 3' , ma in direzione 3' 5' .

Posso considerare lo stesso un response element per il mio fattore di trascrizione?

Il fatto che sia in direzione 3' 5' lo rende funzionale ugualmente?

grazie

chick80
Moderatore

Citt�: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 26 settembre 2007 : 23:54:06

Non sono un esperto a riguardo, ma credo che anche response elements invertiti possano essere funzionali in alcuni casi.

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Neuroscience
Utente

659 Messaggi

Inserito il - 28 settembre 2007 : 01:24:40

Dipende dalla funzione del fattore che lega questa sequenza...
in genere se � un cofattore di qualche metilasi non ha influenza la posizione e direzione..
se � tipo un fattore accessorio della trascrizione � molto importante la distanza, il numero di sequenze ripetute ed il verso.
Cerca su pubmed articoli su quest'argomento e soprattutto chi ha scoperto la sequenza consenso e verifica se tutti hanno lo stesso verso.

Io lo studierei lo stesso, magari potresti essere il primo a scoprire che anche nel verso opposto possa funzionare ugualmente

in bocca al lupo

P.S.: io per sequenza invertita intendo GACAGC -> CTGTCG, se invece � di questo tipo GACAGC->CGACAG in pratca si tratta di un'altra sequenza