Si è possibile fare questa distinzione tramite elettroforesi in gel di agarosio ke separa le molecole, oltre ke x lunghezza (massa molecolare), anke x forma (struttua tridimensionale)...in ordine dovrebbe essere più denso il DNA circolare covalentemente chiuso (plasmide), poi l'RNA a singolo filamento poichè possiede un gruppo OH anke sul C-2, poi il DNA a singolo filamento ed infine il meno denso è la doppia elica di DNA proprio grazie a quello spazio ke si viene a creare tra le due eliche
un altro metodo di separazione in base alla tipologia di acido nucleico è la centrifugazione in gradiente di densità all'equilibrio ke sfrutta la stratificazione del cloruro di cesio
entrambe le tecniche possono essere migliorate se sfruttate con l'aggiunto di bromuro di etidio ke è una moelcola in grado di intercalarsi tra le basi e lo fa con maggiore efficienza in ordine con: DNA doppio filamento--->DNA singolo filamento--->RNA singolo filamento--->plasmidi...quindi il bromuro di etidio aumenta quella ke è la differenza di densità tra le varie forme di acido nucleico da separare