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michela
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio Emilia
23 Messaggi |
 Inserito il - 27 giugno 2005 : 12:32:43
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ciao forumisti!
qualcuno di voi fa analisi con microarray?
Io ho effettuato la mia prima ibridazione la settimana scorsa e mi domandavo se i vetrini possono essere in un qualche modo "puliti" della sonda e ibridati di nuovo con nuovo cDNA marcato. Se qualcuno di voi è a conoscenza della cosa e potesse aiutarmi...ANCHE SOLO CON QUALCHE SUGGERIMENTO...
grazie!
Michela
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Phoenix
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Bollate
17 Messaggi |
 Inserito il - 22 luglio 2005 : 19:59:11
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Quello che ho sempre saputo è che i microarrays non possono essere riutilizzati dopo essere già stati ibridati. O per lo meno questo è quello che succede con i GeneChip array di Affymetrix. Non ho esperienza per quanto riguarda gli spotted arrays.
Una volta però ho provato a lavare un array già ibridato con SDS al 10% e i risultati non sono stati ottimali.
Il mio consiglio è: un array, un'ibridazione.
Spero di averti aiutato. |
Come la fenice rinasco dalle mie ceneri; amo, quindi vivo. |
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michela
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio Emilia
23 Messaggi |
Inserito il - 25 luglio 2005 : 15:39:11
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Ciao phoenix,
anche io sapevo dell'unicità d'uso del vetrino ma noi stiamo cercando di renderli utilizzabili per poter mettere a punto il protocollo senza dover utilizzare (vedi: sprecare) vetrini buoni.
Ti ringrazio comunque della risposta
Michela |
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biotech
Utente Junior
Prov.: Padova
Città: Padova
170 Messaggi |
Inserito il - 12 agosto 2005 : 17:24:06
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| Io l'ho usato il microarray: mi sembra che i vetrini non possano venire puliti e soprattutto si possono scannerizzare solo una volta sola: la seconda vengono peggio. |
http://boincstats.com/signature/user_1342603.gif |
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Saccaromices
Nuovo Arrivato
Città: Reggio Calabria
4 Messaggi |
Inserito il - 03 settembre 2005 : 21:27:57
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"Quello che ho sempre saputo è che i microarrays non possono essere riutilizzati dopo essere già stati ibridati. O per lo meno questo è quello che succede con i GeneChip array di Affymetrix. Non ho esperienza per quanto riguarda gli spotted arrays.
Una volta però ho provato a lavare un array già ibridato con SDS al 10% e i risultati non sono stati ottimali.
Il mio consiglio è: un array, un'ibridazione."
sono pienamente daccordo.....
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nati non fummo per viver come bruti, ma....... |
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Phoenix
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Bollate
17 Messaggi |
Inserito il - 07 settembre 2005 : 11:16:16
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Citazione:
Messaggio inserito da michela
Ciao phoenix,
anche io sapevo dell'unicità d'uso del vetrino ma noi stiamo cercando di renderli utilizzabili per poter mettere a punto il protocollo senza dover utilizzare (vedi: sprecare) vetrini buoni.
Ti ringrazio comunque della risposta
Michela
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Come la fenice rinasco dalle mie ceneri; amo, quindi vivo. |
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michela
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio Emilia
23 Messaggi |
Inserito il - 12 settembre 2005 : 18:15:00
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ciao phoenix!
Ho passato i primi 15 giorni di luglio a strippare i vetrini ibridati nelle condizioni più diverse e i risultati non sono stati un granchè, ma me lo aspettavo.
I vostri suggerimenti quindi erano giusti.
Ci sono molto rimasta però quando, presa dalla disperazione, ho sottoposto a scansione un vetrino pulito e mi sono trovata davanti una bella fluorescenza che, a questo punto, mi domando da dove diamine salti fuori.
Evidentemente c'è qualcosa che mi sfugge...
Ad ogni modo abbiamo ripreso ad ibridare modificando il protocollo in più punti: i problemi di background restano ma forse è più dovuto ad un segnale troppo debole dello spot che ad altro.
E' una cosa fantastica questa degli array ma molto,molto,molto, logorante...e quando dico molto ancora non rendo l'idea...
a presto
M: |
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