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ili
Nuovo Arrivato


Prov.: Pistoia
Città: borgo a buggiano


9 Messaggi

Inserito il - 30 novembre 2007 : 12:40:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ili Invia a ili un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti ho bisogno di un aiuto su come disegnare primers

ho questa sequenza gtg agcagctgg gctggagagaga cgacagggct ggttgcccag ggtccccagg cctctgattc ctcactgatt gctcttag

mi chiede di disegnare una coppia di primers (20 pb) in grado di amplificare questo segmento intronico

help......grazie

ilaria lucarelli

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 30 novembre 2007 : 12:51:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=1655

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malaga
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15 Messaggi

Inserito il - 30 novembre 2007 : 12:59:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di malaga  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di malaga Invia a malaga un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Caratteristiche primers:
Lunghezza: 18-25 nt (20mer)
Composizione in basi: G/C = 50%
Temperatura di fusione (Tm): uguale per i primer
Tm = 2(A+T)°C + 4(C+G)°C
Due C o G al 3’ dei primer (sarebbe meglio,il legame è più stabile;il 3'OH è importante perchè fornisce l'innesco per la polimerizzazione)
Assenza di self-complemetarietà
Assenza di complemetarietà tra i primer

Seguendo queste regole puoi costruire una buona coppia di primers.ciao ciao


malax
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malaga
Nuovo Arrivato



15 Messaggi

Inserito il - 30 novembre 2007 : 14:10:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di malaga  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di malaga Invia a malaga un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In rete c'è un programma,PRIMER3,che data una sequenza disegna due primers per amplificarla...ma dato che è un esercizio teorico credo sia meglio la progettazione senza l'utilizzo di softwareciao ciao

malax
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