Caratteristiche primers: Lunghezza: 18-25 nt (20mer) Composizione in basi: G/C = 50% Temperatura di fusione (Tm): uguale per i primer Tm = 2(A+T)°C + 4(C+G)°C Due C o G al 3’ dei primer (sarebbe meglio,il legame è più stabile;il 3'OH è importante perchè fornisce l'innesco per la polimerizzazione) Assenza di self-complemetarietà Assenza di complemetarietà tra i primer
Seguendo queste regole puoi costruire una buona coppia di primers.ciao ciao
In rete c'è un programma,PRIMER3,che data una sequenza disegna due primers per amplificarla...ma dato che è un esercizio teorico credo sia meglio la progettazione senza l'utilizzo di softwareciao ciao