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ser
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97 Messaggi
Inserito il - 08 dicembre 2007 : 21:21:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ser Invia a ser un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono alle prime armi,i miei studi di genetica all'universitā sono quelli di Mendel.Ora mi sto cimentando con i marcatori molecolari applicate alle piante.Vi espongo il mio ragionamento.Spero sia corretto.Vorrei fare del fingerprinting su una pianta X con ssr,ma non conosco primers specifici su quella specie.A questo punto il mio primo passo č consultare la bibliografia e basarmi sulla trasportabilitā del marcatore e utilizzare i primers per ssr di altre specie della stessa famiglia botanica o genere (ancora meglio).Faccio delle Pcr e noto che c'č amplificazione e magari polimorfismo.A questo punto vorrei provare a costruirne io dei primers specifici.Immagino che dovrei prima sequenziare le bande che ho visualizzato in agarosio che devono essere prelevate e purificate.
E poi?So che bisogna fare l'allineamento se non sbaglio.Come lo faccio?Una volta che ho intercettato la sequenza ripetuta,il primer va fatto sulle regioni adiacenti.

ser
Nuovo Arrivato



97 Messaggi
Inserito il - 11 dicembre 2007 : 09:57:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ser Invia a ser un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Perfavore qualche risposta di incoraggiamento.Grazie
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sissisan
Nuovo Arrivato


Cittā: Milano


3 Messaggi
Inserito il - 12 dicembre 2007 : 17:54:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di sissisan Invia a sissisan un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
le sequenze le trovi su NCBI e per allinearle si usa il BLAST, poi i primers si studiano sulle zone adiacenti, come dici tu.
ma anche per quelli č meglio usare dei programmi specifici per studiare i primers, si trovano free in internet. x es primer expres (se non sbaglio)
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ser
Nuovo Arrivato



97 Messaggi
Inserito il - 12 dicembre 2007 : 19:32:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ser Invia a ser un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie 1000,finalmente una risposta!L'importante č che quanto ho detto sia corretto!
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