per cis, si intendono i fattori che si trovano sullo stesso filamento di DNA, cis = vicini per trans, si intende dei fattori che si trovano su un altro plasmide o sul DNA genomico ed agiscono sul plasmide che consideri, trans = lontano.
insomma dipende dal contesto in cui lo hai sentito.
Lavorando di fantasia, immagino che in cis ci sono le sequenze regolatorie vicine all'origine di preplicazione, mentre in trans ci sono le proteine che si assemblano per generere o regolare la replicazione (es le proteine del primosoma)
ciao! sė gli elementi in trans sono proteine regolatorie che sono reclutate, mentre gli elementi in cis sono sequenze di regolazione che si trovano sul tratto di DNA.
per tommasomoro: non ti chiedo tanto credo, ma potresti ogni tanto essere un pochino piu' gentile nelle tue risposte? grazie!