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serena.s
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3 Messaggi |
 Inserito il - 11 aprile 2008 : 16:59:21
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Ciao a tutti!!
Volevo fare una domanda sull'analisi Southern.
Una volta ottenuto il risultato che mi dice in quale banda si trova il mio frammento legato alla sonda, come faccio a separarlo da eventuali altri frammenti della stessa lunghezza ma non della stessa sequenza presenti nella mia banda?
Grazie!!
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I marcatori di patologia sono come gli ambasciatori: non portano pena, la comunicano solamente. |
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Schuldiner86
Utente Junior
Prov.: Viterbo
Città: Bologna
581 Messaggi |
 Inserito il - 11 aprile 2008 : 18:39:04
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| Io farei una PCR sul frammento di tuo interesse, perché se conosci la sequenza per la sonda il frammento ce l'avrai sequenziato e quindi potrai disegnarti gli oligo...Così, la prima cosa che mi è venuta in mente... |
 
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serena.s
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
 Inserito il - 12 aprile 2008 : 10:26:23
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Giusto! Questo si può fare se conosco la sequenza del frammento!
Ma...ora mi viene un'altra domanda allora: se io invece sto ricercando un gene di cui non conosco l'esatta sequenza? Del tipo, ho la sequenza di un gene di topo e voglio ricercare l'omologo nell'uomo. In questo caso io uso come sonda la sequenza del gene di topo anche se non c'è una complementarità perfetta. Però una volta ottenuto il risultato della Southern non posso disegnarmi gli oligo per la PCR perchè non la conosco la sequenza esatta e, se non erro, sarà difficile far associare due primer con sequenza non esatta!
mmm...
cmq grazie!!! Almeno in parte ho risolto il problema! |
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valia
Moderatore
Prov.: UK
1001 Messaggi |
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serena.s
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3 Messaggi |
Inserito il - 12 aprile 2008 : 10:48:18
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Giustissimo!!! Non ci avevo pensato! Grazie!
Visto che ci sono faccio anche un'altra domanda: ma la Southern di per sè può essere quantitativa? Cioè, posso sapere la quantità iniziale del DNA di interesse? Non so, forse misurando con qualche strumento l'emissione della sonda marcata che si è legata al mio DNA...o roba del genere... |
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Analisi Southern
Didattica
