Perchè per separare frammenti di DNA molto piccoli mediante elettroforesi su gel è tassativo utilizzare gel di poliacrilammide anzichè gel di agarosio?Quali caratteristiche lo contraddistinguono?
Tassativo forse è un po' esagerato... diciamo che il gel di poliacrilammide ti permette di avere una risoluzione più elevata perchè le maglie del gel sono più fitte rispetto a quelle di un gel di agarosio, e quindi permettono di separare anche frammenti molto piccoli, anche con 1 solo nucleotide di differenza in lunghezza.
Ad ogni modo, su un gel di agarosio al 2%, ad esempio, riesci tranquillamente a separare frammenti attorno a 100 bp.