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marina1983
Nuovo Arrivato



18 Messaggi
Inserito il - 18 maggio 2008 : 16:45:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di marina1983 Invia a marina1983 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
come si fa a costruire un albero filogenetico tra le proteine con elevata omologia di sequenza?

Schuldiner86
Utente Junior

Biotech

Prov.: Viterbo
Cittā: Bologna


581 Messaggi
Inserito il - 18 maggio 2008 : 17:37:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Schuldiner86  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Schuldiner86  Invia a Schuldiner86 un messaggio Yahoo! Invia a Schuldiner86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Fai prima un BLAST sul sito di NCBI, prendi tutte le sequenze proteiche in formato FASTA dell'allineamento e te le salvi in un file di testo...Poi vai su ClustalW e usi il file di testo come query, sulla pagina dei risultati ci sta View Guide Tree...Per vedere le relazioni filogenetiche in cui i rami del grafico tengono conto del tempo Clicca su Show as Phylogram Tree sulla pagina che ti si aprirā...


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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 19 maggio 2008 : 00:11:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vedi anche altre discussioni, tipo questa:
- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=7705
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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