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Autore

Discussione

sproken
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2008 : 19:40:16

Allora.. il problema da formulare � semplice..
Data una sequenza nucleotidica, se ho due primers per pcr, come faccio a sapere se si appaiano in zone non volute?
(Dato che nel gel la banda � troppo pesante)
Figurarsi che ho provato ad occhio, ma sono sicuro che ci sia il modo di farlo col pc pi� accuratamente..
Sono aperto ad ogni suggerimento!!!
Grazie e Ciao

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2008 : 21:53:16

Prova qui:
- http://fokker.wi.mit.edu/primer3/input.htm

Dai una occhiata anche a questa discussione:
- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=1655

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

sproken
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 28 maggio 2008 : 18:52:11

ho scaricato perlprimer e sono riuscito.. thanks

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 29 maggio 2008 : 11:07:46

ok. Scusa per aver modificato il titolo del topic, ma era un po' troppo generico.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

Cangrande
Utente Junior

Prov.: Verona

280 Messaggi

Inserito il - 30 maggio 2008 : 17:47:55

Secondo me il tuo problema non � quello dei dimeri etero o omo ma di qualche regione del genoma su cui lavori che permette l'attacco dei tuoi primers. Hanno sequenziato la specie su cui lavori?

Magnifico atque victoriosissimo Domino, Domino Kani Grandi de la Scala.