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terreno85
Utente Junior

235 Messaggi

Inserito il - 30 maggio 2008 : 13:09:18

Ragazzi come faccio a correlare una mappa genetica ad una fisica ad una citogenetica.
Da quello che so o per meglio che riesco ad arrivare con il ragionamento perche nn ce strito nulla sui libri � qst:
Si possono amplificare con PCR regioni genetiche che presentano STS e si possono correlare ai conting delle mappe fisiche con souther blottin e infine alle mappe citogenetiche trasmite FISH .
Secondo voi ?

Una teoria pu� esserre provata da un esperimento. Ma nessun percorso guida dall'esperimento alla nascita di una teoria

frau_frosch
Utente Junior

Citt�: Boston

225 Messaggi

Inserito il - 30 maggio 2008 : 18:53:11

Premettendo che la FISH E' una tecnica di mappatura fisica, le proposte che hai fatto sono buone. In generale una mappa genetica si basa sulla trasmissione di marker, per cui ogni metodo che ti localizzi quel marker su un sito fisico ti va bene. Quindi puoi usare sia un saggio di amplificazione (PCR) o di ibridazione (FISH, ibridazione radioattiva su library, Southern su ibridi monocromosomici..).

memole
Utente Junior

Prov.: Brindisi
Citt�: brindisi

577 Messaggi

Inserito il - 30 maggio 2008 : 21:37:22

Il tuo approccio sembra corretto anche a me.
Una alternativa potrebbe errere questa: partire da un'analisi di linkage tra un gene di interesse e un marcatore molecolare (in questo modo ti costruisci una mappa di associazione, quindi una mappa genetica). Dopo di che usi delle sonde per andare ad individuare la regione genomica, ad esempio una sonda polimorfica, e poi vai a fare la mappa fisica della regione stessa, tramite analisi di restizione o ancora meglio analisi di sequenza.