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Autore Discussione  

greace
Nuovo Arrivato

Cittā: ancona


43 Messaggi
Inserito il - 07 giugno 2008 : 11:35:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di greace Invia a greace un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
chi mi sa dire che cosa vuol dire la voce QUERY COVERAGE quando si effettua una ricerca in banca dati con BLAST???
grazie a tutti
greace...

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 07 giugno 2008 : 12:17:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La percentuale delle basi appartenenti alla tua sequenza query che sono state incluse nell'allineamento.

Per esempio, se tu hai una sequenza di 10 basi:
ACTGACTGAC

e solo 4 di queste sono incluse nell'allineamento, query coverage é uguale a 0.4.

-> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Newsltr/V15N2/BLView.html (in fondo)
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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greace
Nuovo Arrivato

Cittā: ancona


43 Messaggi
Inserito il - 07 giugno 2008 : 12:25:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di greace Invia a greace un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grzie mille Dallolio, mi sei stato di grande aiuto
greace...
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