ciao! ho un problema..... sto valutando l'efficacia dei miei primer in real time pcr con sybr green! dopo amplificazione nella curva di melting ho un solo picco quindi deduco che non ho formazione di dimeri ne contaminazioni....mentre ho ritrovato amplificazione nel mio controllo negativo (no DNA)! come è possibile? grazie mille
potresti avere scambiato le happy (eppendorf) se nei tuoi campioni di controllo positivo non hai ottenuto niente. Senn' come ha detto Verina molto probabilmente non avendo cambiato puntale hai contaminato...
concordo su contaminazione: cambia acqua o usa un'aliquota diversa di primers o una mix SYBR differente. Ma non trovate che ormai, con i costi a reazione ormai irrisori delle sonde TaqMan, ormai non valga più la pena fare SYBR? Incideranno per 5 centesimi a reazione, ma non devi mettere a punto nulla...boh, parere mio...