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dallolio_gm
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Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 13 giugno 2008 : 12:44:10
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Per le sequenze proteiche devi usare una matrice di sostituzione, che ti dice la probabilità di passare da un aminoacido ad un altro.
Anche per le sequenze nucleotidiche si possono usare delle matrici di sostituzione, ma in genere si preferisce usare una stessa probabilità per le 6 possibili transizioni, o si adottano dei modelli che riflettono probabilità di sostituzione diverse per zone codificanti e non, oppure semplicemente si usa l'identità piuttosto che la similarità. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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e-value e similarità
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Inserito il - 10 giugno 2008 : 17:47:31
