Allora vediamo se riesco ad esserti un pò utile: -per determinare la porzione N-terminale della proteina puoi ricorrere ad un metodo chimico, ad esempio utilizzando il reattivo di Sanger o quello di Edman. L'HPLC ti serve per capire quale aminoacido identifichi; -per rendere più semplice il lavoro invece che usare la proteina integra la puoi indizialmente frammentare usando delle endopeptidasi, tipo tripsina, chimitripsina, etc; -i peptidi che ottieni li puoi separare tramite HPLC, in modo da separarli in base alle caratteristiche chimico fisiche comuni. Questo ti andrà poi a facilitare nelle analisi successive; -si parla di puzzle perchè i trattamenti con proteasi non li andrai a fare in condizioni drastiche ma blande, così da ottenere frammenti che tra loro possano essere sovrapponibili. Teeminate le analisi sui singoli peptidi sai in grado di ricostruire la sequenza primaria della tua proteina. Spero di esserti stata utile