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Discussione

AmbienteLife
Utente Junior

Prov.: Bari
Città: Bari

204 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2008 : 16:32:58

Salveeee ho fatto un allineamento tra due biosequenze e vorrei capire la differenza tra il valore IDENTITY ed il valore SIMILARITY grazieeeeee

vi prego rispondetemi presto ho l'esame tra pokissimo

Guardiamo l'ambiente e rispettiamolo di più... è la nostra casa...

Rosy85
Utente Junior

234 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2008 : 18:59:31

Hmm.. Dunque, se hai allineato due sequenze amminoacidiche ed hai utilizzato un programma del pacchetto blast (tipo blastp), con i miei rudimenti di bioinformatica forse posso provare a rispondere

Identities sono gli amminoacidi che sono proprio uguali in quella posizione nelle sequenze allineate (due alanine ad esempio); invece "simili" sono gli amminoacidi che nell'allineamento appunto hanno caratteristiche simili (ad esempio sono entrambi carichi positicamente, o entrambi aromatici).
Identici + simili=positivi. Ovvero vengono considerati positivi i residui che risultano identici E quelli che risultano simili.

Spero di esserti stata d'aiuto... Altrimenti aspetta il parere di qualcuno più esperto

Ciao e in bocca al lupo!

Nasce, cresce e poi finisce. Per quanto triste è la legge universale.
Ciò che è stato nn tornerà. Il massimo che puoi fare è sperare che quello che sarà, sia meglio.
Nessun rimorso nè rimpianto, è inutile.
Carpe diem: panta rei