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Discussione |
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ilalia
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: napoli
55 Messaggi |
 Inserito il - 17 luglio 2008 : 15:35:05
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sapreste spiegarmi come funzionano i vari fattori dello spliceosoma (U1 U2 U4 U5 U6) e come intervengono nel meccanismo di splicing???
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Dana86
Nuovo Arrivato
Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
 Inserito il - 17 luglio 2008 : 18:34:29
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prima di tutto le sequenze di inizio e fine introne sono sequenze ripetute.i componenti dello spliceosoma costituiti da una parte proteica e una parte di rna riconoscono queste sequenze in maniera specifica per complementarietà tra la loro parte di rna e la sequenza di inizio e fine introne appunto.
in particolare U1 si mette dalla parte 5' della sequenza intronica,U2 si posiziona verso il 3' in particolare riconoscendo una adenina sempre presente nelle sequenze ripetute di fine introne,U5 invece si posiziona propria al 3'cioè proprio alla fine dell'introne.
si crea un legame fosfodiesterico tra l'adenina riconosciuta da U2 e il gruppo e la porzione riconosciuta da U1 formando un cappio che stacca l'introne!la ligasi attacca i due esoni rimasti!spero di essere riuscita a farmi capire! |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1914 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 07:48:44
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Citazione:
Messaggio inserito da Dana86
prima di tutto le sequenze di inizio e fine introne sono sequenze ripetute
Ciao Dana86,
potresti dirmi dove hai letto questo fatto? |
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frau_frosch
Utente Junior
Città: Boston
225 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 12:16:01
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| Forse intendevi dire conservate? |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1914 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 12:21:59
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Citazione:
Messaggio inserito da frau_frosch
Forse intendevi dire conservate?
eppure non mi torna se non per i siti donatori & accettori di splicing |
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Dana86
Nuovo Arrivato
Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:36:40
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si si forse mi sn spiegata male!ripetute nel senso che sn sempre quelle cioè conservate!cmq ho una diapositiva che spiega il legame...credo sia presa dall'alberts!sono lucidi del nostro professore e la maggior parte delle foto lui le ha prese dall'alberts! |
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ilalia
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: napoli
55 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:40:45
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| e per il fattore U4 e U6??? |
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Dana86
Nuovo Arrivato
Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:42:48
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scusate di nuovo!le sequenze sono ripetute e conservate!sn entrambe!perchè sono ripetute proprio per il fatto che si ripetono ad ogni inizio e fine introne!conservate pure credo...in genere con conservate si intende conservate tra diverse specie...e visto che i componenti dello spliceosoma sn loro stessi abbastanza simili tra glio organismi eucariotici immagino che allora anche le sequenze che devono riconoscere sono abbastanza simili!ma nn giurerei proprio identiche!nn so se mi sn spiegata! |
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Dana86
Nuovo Arrivato
Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:46:35
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| U4 e U6 sono in realtà insieme!mi pare siano costituiti dalla stessa parte proteica,però qst nello specifico nn te lo so dire,so che vengono reclutati in prossimità del sito di splicing nn appena gli altri si legano,contribuiranno a tagliare,ma su questo nn so proprio!è una cosa che mi sn chiesta anche io ma che dalla diapositiva che ho nn riesco a dedurre! |
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ilalia
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: napoli
55 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:47:47
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| capisco!!! |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1914 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:54:17
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| be se si ripetono ad ogni inizio dell introne credo che sia piu' giusto dire conservate...almeno io non direi mai che gli introno sono costituiti da sequenze ripetute |
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Dana86
Nuovo Arrivato
Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 13:58:56
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| beh giustissimo!l'introne nn è costituito da sequenze ripetute!ma le zone di inizio e fine sono ripetute!cmq nn credo sia questo il punto!se volete cmq metto una diapositiva magari con una immagine si capisce meglio quello che volevo dire!forse nn sono stata brava a spiegarmi! |
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ilalia
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: napoli
55 Messaggi |
Inserito il - 18 luglio 2008 : 14:01:42
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| beh se puoi te ne sarei grata |
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Dana86
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Prov.: VT
Città: Viterbo
114 Messaggi |
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Gio Gio
Nuovo Arrivato
17 Messaggi |
Inserito il - 23 luglio 2008 : 18:29:11
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Gli introni trascritti dall’RNA polimeras iII vengono allontanati attraverso un corpo di splicing:lo spliceosoma.E’ una molecola molto grossa che contiene:proteine,piccoli RNA,proteine legate a piccoli RNA e fattori di splicing.
I piccoli RNA sono quelli ricchi un uracile ed interagiscono con proteine,ce ne sono delle altre che sono specifiche del piccolo complesso U,nel caso dello splicing ci interessano U1,2,4,5,6(piccoli RNA complessati con proteine fondamentali per lo splicing).Alcuni piccoli RNA sono trascritti da Pol II altri da Pol III,quelli della serie U sono tutti trascritti da Pol II tranne U6 che è trascritto da Pol III.
Il 5',il 3’e il punto di ramificazione vengono riconosciuti da interazioni RNA-RNA ed è la componente ad RNA che riesce a fare taglio e cuci(attività ribozimatica).
U1 identifica il sito donatore di splicing al 5’ dell’introne.
U2 ha la capacità di complementare con la zona di ramificazione,però U2 non può posizionarsi da solo ma ha bisogno che U1 si sia già posizionato e che attraverso dei fattori interagenti si sia posizionata un’altra componente che è una proteina-->U2AF.
Il complesso proteico U2AF si posiziona al sito accettore di splicing,cioè al 3’;solo in questo momento può arrivare U2 che interagisce per complementarietà con la sequenza del punto di ramificazione
A questo punto intervengono 3 piccoli RNA U4,5,6 arrivano tutti e tre insieme
U4 ha in una zona appaiamento con U6
U4 serve da carrier che porta U6 nel sito dove andrà a complementare con U2
U5 si posiziona nella zona più terminale del complesso
Quando sono arrivati tutti i fattori:U1 viene spostato e non entra nel momento del taglio ed è sostituito nella sua posizione da U6 che sta interagendo con U2
L’interazione tra i piccoli RNA assembla una struttura che fa avvenire il taglio al 5’che viene immediatamente legato al punto di ramificazione
rottura al 3’e legame dell' esone 1 ed esone 2
allontanamento dell'introne sottoforma di lazzo
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splicing
Didattica
ho provato a mandarti anche via messaggio privato!nel frattempo prova qui
