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chick80
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Inserito il - 21 gennaio 2004 : 16:51:43
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Dipende da molti fattori.
La sequenza del DNA è forse il più importante, in quanto la temperatura di melting del DNA è correlata alla %GC (al momento non ricordo la formula...).
La concentrazione del DNA può influire nel senso che se raddoppi la quantità di DNA per avere una buona amplificazione devi anche raddoppiare le quantità di nucleotidi, primers, Taq etc.
Anche fattori come pH e forza ionica possono influenzare la reazione, perchè modificano l'attività della Taq. In questo caso, però, di solito non si fanno modifiche, perchè si usano le concentrazioni che ti dice di usare la casa produttrice della Taq, e che sono quindi ottimizzate per quell'enzima.
Comunque in generale il fattore più importante è la sequenza. Una variazione anche di meno di 1°C sulla temperatura di annealing può far variare molto il risultato della PCR.
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