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rya
Nuovo Arrivato
75 Messaggi |
 Inserito il - 18 settembre 2008 : 10:21:04
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1-RFLP,VNTR,SNP...come differiscono in termini di lunghezza e metodo usato per individuarli?
2- qual è la differenza tra un gene e un ORF? Come si fa ad attribuire una funzione ad una ORF sconosciuta?
3- un frammento sequenziato di Drosophila è stato usato in una ricerca BLAST.La migliore affinità(35% di somiglianza ) è stata riscontrata con il gene per una chinasi di Neurospora. Secondo voi , quest'affinità significa che la sequenza di Drosophila contiene il gene per una chinasi?
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bio9
Nuovo Arrivato
Città: Bari
76 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 12:44:28
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RFLP: una mutazione associata ad una malattia genetica può causare la perdita o l'acquisizione di un sito di restrizione nel gene o in una regione fiancheggiante. nel genoma umano si possono trovare mappe di restrizione diverse in individui diversi per le stesse regioni cromosomiche. i profili di restrizione diversi producono quelli che sono chiamati RFLP cioè polimorfismi di lunghezza dei frammenti di DNA ottenuti per taglio con enzimi di restrizione. vi sono molti casi in cui un RFLP è associato con un gene che si sa può causare una malattia.
VNTR:Tranne i gemelli identici non ci sono due individui che hanno esattamente lo stesso genoma e questo a portato allo sviluppo della tipizzazione del DNA, tecniche che sono in uso in medicina legale, nei test di paternità e maternità. La tipizzazione del DNA si basa sull'analisi dei marcatori. i marcatori più utili per la tipizzazione del DNA sono quelli molto polimorfici, per i quali gli individui della popolazione hanno numerose differenze. ci sono molte regioni nel genoma che mostrano variabilità nel numero di corte sequenze ripetute in tandem. quando l'unità ripetuta è lunga qualche decina di bp (paia di basi) è chiamata VNTR detta anche minisatellite.
SNP:polimorfismi di singoli nucleotidi. gli alleli di un SNP possono essere facilmente tipizzati mediante analisi di ibridazione con oligonucleotidi. |
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gslori
Nuovo Arrivato
Prov.: Forlì-Cesena
Città: Savignano sul Rubicone
107 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 13:16:34
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| L'unica cosa è che le unità ripetute che vanno sotto il nome di VNTR sono microsatelliti con unità ripetute da 1 a 4 basi quindi un po' più piccole dei minisatelliti. |
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gslori
Nuovo Arrivato
Prov.: Forlì-Cesena
Città: Savignano sul Rubicone
107 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 13:20:15
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| Ah non capisco bene la seconda domanda. Bè l'orf è la CDS (coding sequence) quindi la parte del gene che è effettivamente codificante per proteina ovvero la parte di mRNA fra 5primo UTR e 3 primoUTR |
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rya
Nuovo Arrivato
75 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 17:13:48
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grazie mille!!!!!!
Ho trascritto le domande così com'erano...credo comunque anch'io che per ORF s'intenda la parte realmente codificante
l'ultima mi lascia un po' perplessa...secondo me è no, perchè la % è inferiore al 50%  |
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gslori
Nuovo Arrivato
Prov.: Forlì-Cesena
Città: Savignano sul Rubicone
107 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 18:16:00
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| Secondo me non è sufficiente una somiglianza del 35 per cento. |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 19 settembre 2008 : 22:35:14
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Per favore la prossima volta evita di aggregare più domande in un solo topic.
Altrimenti rendi difficile agli altri utenti seguire la discussione, con il risultato che tra l'altro ottieni meno risposte.
L'ideale é aprire un topic per ogni domanda, possibilmente con un titolo significativo.
Inoltre cerca di fare una ricerca sul forum prima di aprire nuovi topic, per verificare se la tua domanda é già stata posta. Per esempio, quella su cosa é una ORF é una delle domande poste più frequentemente sul forum.
In ogni caso, per stabilirne la funzione, basta blastarla :). |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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rya
Nuovo Arrivato
75 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2008 : 09:32:47
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scusami...la prossima volta farò così
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2008 : 10:20:28
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ok grazie  . |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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3 domande di genomica
