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Scienziati spagnoli rivelano la mappa dinamica delle proteine

Proteina hla


Un gruppo di scienziati spagnoli ha pubblicato la prima mappa in assoluto del comportamento dinamico delle proteine.

Pubblicata sulla rivista scientifica «Proceedings of the National Academ

Un gruppo di scienziati spagnoli ha pubblicato la prima mappa in assoluto del comportamento dinamico delle proteine.

Pubblicata sulla rivista scientifica «Proceedings of the National Academy of Sciences USA», la mappa mostra come le proteine siano in grado di spostarsi e formare complessi chimici con altre molecole.

Scopo del gruppo di studiosi dell'Istituto di ricerca in biomedicina (IRB di Barcellona), del programma di scienze della vita del Centro supercomputazionale di Barcellona (Barcelona Supercomputing Center, BSC) e dell'Istituto nazionale di bioinformatica (INB) è definire le proprietà dinamiche delle proteine al fine di prevedere le strutture che esse possono formare in base alla presenza di leganti o modifiche.

Lo studio è il primo di un più ampio progetto scientifico volto a creare una vasta libreria di 1 900 proteine in movimento, grazie alle risorse di MareNostrum, il più potente supercomputer d'Europa.
Ribattezzata MoDel, la banca dati consentirà agli utenti di osservare come le strutture 3D delle proteine rappresentative si spostano nel loro ambiente.

«MoDel ha lo scopo di creare una "quarta dimensione" per le strutture proteiche, fornendo in tal modo uno scenario completo delle possibili conformazioni che l'intero proteoma (la rete completa delle interazioni cellulari delle proteine) può assumere nel tempo», spiega Modesto Orozco dell'IRB di Barcellona, direttore del progetto.

«In un futuro prossimo, un biochimico sarà in grado di capire il comportamento di una proteina o di progettare un farmaco capace di interagire con tale proteina, attingendo alla conoscenza non solo di una singola struttura, ma di un intero repertorio che si forma spontaneamente in presenza di condizioni fisiologiche», ha aggiunto.

I ricercatori ritengono che la comprensione della struttura e della dinamica proteica aprirà nuove strade per lo sviluppo di nuovi farmaci.

Fonte: Cordis (17/01/2007)
Pubblicato in Biochimica e Biologia Cellulare
Tag: MoDel, proteine
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