Lecci PP, Bacci S Metodi di conteggio cellulare

Descrizione

Nel seguente algoritmo sono descritti tutti i passaggi necessari ad effettuare una operazione di conteggio cellulare tramite l’utilizzo del programma di analisi d’immagine Image J.
Con questo metodo è possibile individuare e analizzare le aree dell’immagine riconducibili agli elementi cellulari evidenziati.

Sequenza delle operazioni :
1.Aprire il programma ImageJ 64
2.File →Open...
3.Selezionare l’immagine desiderata in formato .JPEG e aprire
4.Selezionare con il puntatore in modalità *rectangular* una piccola area dell’immagine completamente nera.
5.Analyze →Measure (ctrl+M)
6.Cliccare all’interno dell’area selezionata e premere il tasto DEL. (lo sfondo selezionato diventa bianco)
7.Analyze → Measure (ctrl+M)
8.Spostare l’area selezionata dal puntatore in modalità *rectangular* in una porzione di immagine con fondo intermedio (grigio)
9.Analize →Measure (ctrl+M)
10.Copiare i dati comparsi sulla finestra Results su un foglio elettronico
11. Moltiplicare il valore Max della misurazione del fondo per il fattore 1.5
12.Image →Adjust →Threshold... (ctrl+Maiusc+T): si apre la finestra Threshold.
13.Selezionare l’opzione Dark background
14.Impostare il primo cursore al valore ottenuto dal punto 11. (il secondo è auto imposatato a 255)→Apply
15.Analyze →Analyze Particles... si apre la finestra Analyze Particles
16.Impostare Size(pixel^2) a 50-infinity
17.Impostare Circularity a 0.00-1.00
18.Impostare Show a Outlines
19.Selezionare tra le opzioni:Display results – Clear results – Include holes → Ok
20.Selezionare No alla casella Save Measurments
21.Compare la finestra Drawing in cui sono presenti e numerate tutte le aree individuate dal software
22.Nella finestra Results compaiono i valori di tutte le aree indiviuate
23.Copiare i valori della finestra results su un foglio elettronico e salvare.
24.Il conteggio finale si ottiene eliminando la prima area individuata in quanto quest’ultima è stata selezionata arbitrariamente da voi.