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Lecci PP, Bacci S Metodi di conteggio cellulare Descrizione Nel seguente algoritmo sono descritti tutti i passaggi necessari ad effettuare una operazione di conteggio cellulare tramite l’utilizzo del programma di analisi d’immagine Image J. Con questo metodo è possibile individuare e analizzare le aree dell’immagine riconducibili agli elementi cellulari evidenziati. 1.Aprire il programma ImageJ 64 2.File →Open... 3.Selezionare l’immagine desiderata in formato .JPEG e aprire 4.Selezionare con il puntatore in modalità *rectangular* una piccola area dell’immagine completamente nera. 5.Analyze →Measure (ctrl+M) 6.Cliccare all’interno dell’area selezionata e premere il tasto DEL. (lo sfondo selezionato diventa bianco) 7.Analyze → Measure (ctrl+M) 8.Spostare l’area selezionata dal puntatore in modalità *rectangular* in una porzione di immagine con fondo intermedio (grigio) 9.Analize →Measure (ctrl+M) 10.Copiare i dati comparsi sulla finestra Results su un foglio elettronico 11. Moltiplicare il valore Max della misurazione del fondo per il fattore 1.5 12.Image →Adjust →Threshold... (ctrl+Maiusc+T): si apre la finestra Threshold. 13.Selezionare l’opzione Dark background 14.Impostare il primo cursore al valore ottenuto dal punto 11. (il secondo è auto imposatato a 255)→Apply 15.Analyze →Analyze Particles... si apre la finestra Analyze Particles 16.Impostare Size(pixel^2) a 50-infinity 17.Impostare Circularity a 0.00-1.00 18.Impostare Show a Outlines 19.Selezionare tra le opzioni:Display results – Clear results – Include holes → Ok 20.Selezionare No alla casella Save Measurments 21.Compare la finestra Drawing in cui sono presenti e numerate tutte le aree individuate dal software 22.Nella finestra Results compaiono i valori di tutte le aree indiviuate 23.Copiare i valori della finestra results su un foglio elettronico e salvare. 24.Il conteggio finale si ottiene eliminando la prima area individuata in quanto quest’ultima è stata selezionata arbitrariamente da voi. |
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